日菲部队间《互惠准入协定》规定了日菲两国一方的部队访问另一方国家并开展合作活动时的手续以及该部队的法律地位等事项。通过这一协定，今后日本与菲律宾两国在联合演习、灾害救援等合作活动的实施上将更加顺畅，同时双方部队之间的互操作性也有望得到提升。

日本外务省指出：在地区安全保障环境日益严峻的背景下，菲律宾位于海上交通线的重要战略要地，是与我国共享基本价值观和原则的战略伙伴。该协定的生效，将进一步推动两国在安全保障与防卫方面的合作，并为印度太平洋地区的和平与稳定提供更加坚实的保障。

菲律宾在2024年8月2日，与日本在南海举行首次联合军事演习，今年6月14日，日本和菲律宾在南海举行联合军事演习，并首次邀请日、菲媒体登临参演舰艇，观看反潜战演习等活动。该协定的生效，将进一步推进两国在对方国家举行军事演习和军事合作的频繁、有效、顺畅进行。

日本防卫大臣中谷元于6月1日在访问新加坡期间，与菲律宾国防部长特奥多罗举行会谈。双方就合作应对在东海与南海强化威吓行为的中国达成共识，同意通过强化日本自卫队与菲律宾军队之间的协作来加以遏制。同时，双方还确认将推动防卫装备的转移和技术合作。

菲律宾官员表示，在印太地区紧张局势加剧之际，该协定是两国安全关系的重要里程碑。

日本参议院今年6月6日召开全体会议，表决并批准了《互惠准入协定》（RAA）。外相岩屋毅在会后的记者会上表示：“期待其能牢固支撑印度太平洋地区的稳定。”