会谈伊始，石破首相首先对李总统此次访日表示欢迎，并指出，自李在明总统就任以来，首次双边访问选择日本作为目的地，这是邦交正常化以来的首次，能够以如此良好的形式实现“穿梭外交”，令人欣喜。两国首脑对此次“穿梭外交”的启动表示欢迎。

双方首脑就日韩关系的整体情况进行了坦率的意见交换，并一致同意在1965年邦交正常化以来所奠定的基础上，以面向未来、稳定并大幅发展的方向推动两国关系。

双方首脑再次确认了实现朝鲜半岛完全无核化与构建永久和平的坚定意志，并一致同意在对朝政策上继续保持两国间的合作。

双方首脑确认，为应对朝鲜的核与导弹威胁，应以日美韩合作为基础，继续与国际社会合作，确保联合国安理会对朝制裁决议得到切实履行。同时，强调有必要共同应对朝鲜非法网络活动以及俄朝军事合作的加强，并同时强调通过对话和外交方式和平解决朝鲜核与导弹问题的重要性。

双方首脑一致认为，解决绑架问题十分重要性。

双方首脑一致认为，在瞬息万变的国际形势中，推动牢固的日韩、日韩美合作至关重要，并决定继续营造日韩关系发展与日韩美合作加强之间的良性循环。

双方首脑再次确认，在应对国际社会各种课题上，两国都是重要的合作伙伴，并决定为确保今年10月在韩国庆州召开的APEC首脑会议，以及在日本召开的日韩中首脑会议顺利成功而相互合作。

双方首脑一致同意，在安全保障与经济安全保障领域，在当前战略环境下，充分利用日韩副外长战略对话等机会，共享战略认知，并在日韩、日韩美框架下加以应对。

双方首脑还就地方振兴、少子高龄化与人口急减、农业、以及确保应对灾害的韧性等两国共同面临的社会与经济课题达成共识，同意建立两国政府间的协商机制，以共享经验、合作寻求解决方案。同时，双方欢迎两国间工作度假制度的扩大，并决定政府将推动相关举措，以促进两国国民之间的交流与相互理解。

双方首脑一致同意，作为经济领域的新方向，将进一步推进在氢能源、氨能源、人工智能等方面的双边合作。