法新社马尼拉报道，据菲律宾国家安全委员会（NSC）称，投毒事件始于去年，地点位于南沙群岛的第二托马斯浅滩（菲律宾称阿云津礁， 中国称仁爱礁）附近。该安全委员会副总干事科内利奥·瓦伦西亚在新闻发布会上表示，使用氰化物“是一种旨在摧毁当地鱼类种群的破坏行为，从而不仅剥夺了海军人员的重要食物来源”，还面临着接触受污染水域和食用中毒鱼类的风险。

菲律宾海军发言人罗伊·文森特·特立尼达证实，目前尚无士兵的毒物检测呈阳性。他解释说，菲律宾军队分别在2025年2月、7月和10月缴获了十瓶中国渔船投掷的氰化物。他介绍，上个月，士兵们目睹了中国船员在沙洲附近水域投毒。他补充说，随后的分析显示该地点存在氰化物。

菲律宾方面称，使用这种剧毒化学物质“是一种破坏行为”，会“损害”菲律宾马德雷山号（BRP Sierra Madre）的稳定性。马德雷山号是一艘二战时期建造的军舰，1999年，马尼拉故意使这艘二战时期的舰艇搁浅，以维护其领土主张。目前作为菲律宾军事基地使用。

法新社报道称，国家安全委员会计划下周向菲律宾外交部提交一份报告，该报告可能成为发起外交抗议的依据。马尼拉方面也已下令海军和海岸警卫队加强巡逻。

就投放氰化物一事，法新社联系中国大使馆后，未立即得到回应。

中国外交部周一通过例行记者会称：“菲方非法侵扰正常捕鱼的中国渔船，抢夺渔民生活物资，还自导自演所谓“氰化物”闹剧，完全不具有可信度，不值一驳。”

南沙群岛是中菲两国存在战略争议的海域，也是两国冲突频发的地区。北京方面援引历史论据，声称对南海几乎所有岛礁拥有主权，并对国际仲裁法庭认定其主张缺乏法律依据的裁决提出异议。马尼拉和北京经常在该争议地区发生冲突。

2024年6月，一名菲律宾水兵在菲律宾海军试图向驻扎在第二托马斯浅滩的部队运送补给时，遭到中国海警的袭击，失去了一根拇指。当时，中国海警手持刀、棍棒和斧头进行阻挠。

中菲在南中国海域曾围绕“谁是生态环境破坏者”的问题针锋相对。中国2012年实际控制黄岩岛后，菲律宾多次指控中国渔民在附近海域使用氰化物非法捕鱼，破坏那里的珊瑚礁。