重建后的皇岗口岸10月12日早上6时30分正式启用，为旅客和客运车辆提供24小时通关服务；原有的深圳皇岗口岸临时旅检楼和香港落马洲管制站同时停止运作。本站10月9日报道过港深两地公布的开通日期。
受影响的是经皇岗往返深港的旅客，其中有住在深圳、在香港上班的跨境上班族。新口岸实行“一地两检”，旅客只需排队一次、查验证件一次、核实身份一次，就能在同一座大楼里完成两地出入境手续；过去经皇岗口岸要换乘接驳车。
第一位走人工通道从香港到深圳的旅客黄先生对媒体说，以前坐接驳车要花半个多小时，这次“10分钟内就可以”，“我觉得比福田快很多”。第一位走自助通道从香港到深圳的黄女士也对媒体说，她平日会用深圳湾和福田等口岸，新口岸“效率大大提升且不用再挤接驳车很累，很消耗时间”。第一位从深圳到香港的旅客陈先生对媒体说，以前走旧口岸通关要40分钟，还要换乘接驳车；他过去最常经福田口岸到香港，如果新口岸真的能缩短通关时间，以后会倾向用新口岸。
新口岸设置134条合作查验快捷通道，数量是原来的4.5倍；车辆查验通道28条，是原来的3.5倍；旅客通关时间由30分钟缩短到5分钟。车辆通关由深圳边检、深圳海关、香港入境处、香港海关和香港卫生署五方联合查验，司机停车一次就能完成两地查验。
深圳市口岸办公室口岸一处处长薛华明说，旧皇岗口岸每日客流量约5万人次，预计新口岸启用初期每日客流量可达10万至20万人次，长远有望突破30万人次。香港入境事务处的统计显示，落马洲管制站停用前一天（10月11日）入境31873人次、出境21550人次，合共53423人次。
数据：香港入境事务处每日出入境旅客流量统计
亚太经济合作组织（APEC）峰会下个月在深圳举行。薛华明说，口岸为外籍旅客设置了一站式服务中心，并安排专门的APEC服务人员和翻译设备。
茉莉花观察
这一节是茉莉花的看法，依据是上文的事实。
我们的分析新口岸的通道和通关速度都已经到位，能不能做到初期每日10万至20万人次，要看旅客愿不愿意从别的口岸转过来。旧口岸停用前一天合共约5.3万人次，而第一批旅客里，就有人说新口岸如果真能缩短通关时间，以后会倾向不走福田、改用新口岸。
不同看法民建联新界北议员姚铭在开通前说，往返口岸的交通配套明显不足，建议当局尽快研究增设跨境直通巴士服务。我们同意，往返口岸的交通够不够，开通第一天还判断不了；新口岸要做到每日10万人次以上，往返口岸的交通也要跟得上，这还要检验。
展望香港入境处每天公布的旅客统计里，新皇岗口岸的单日出入境人次什么时候超过10万。我们判断，到2026年10月31日，入境处统计的新皇岗口岸单日出入境旅客会超过10万人次。新口岸的快捷通道是原来的4.5倍，第一批旅客里已有人说以后会倾向用新口岸；下个月在深圳举行的APEC峰会，口岸也已经为外籍旅客作了安排。
新口岸的单日人次如果仍在旧口岸停用前一天的53423人次上下，就还没有达到口岸办预计的初期每日10万至20万人次；入境处每天公布的数字会给出答案。
